ما يجب معرفته
- ملف FNA هو ملف FASTA بتنسيق DNA و Protein Sequence Alignment.
- افتح واحدًا مع Geneious.
- التحويل إلى FASTA وتنسيقات مماثلة باستخدام نفس البرنامج.
تشرح هذه المقالة ماهية ملف FNA ، وكيفية فتحه ، وكيفية حفظه بتنسيق مختلف مثل FASTA ، GB ، VCF ، الصور ، إلخ.
ما هو ملف FNA؟
الملف بامتداد ملف FNA هو ملف FASTA Format DNA و Protein Sequence Alignment الذي يخزن معلومات DNA التي يمكن استخدامها بواسطة برنامج البيولوجيا الجزيئية.
ملفات FNA ، على وجه التحديد ، يمكن استخدامها للاحتفاظ بمعلومات الحمض النووي فقط بينما تحتوي تنسيقات FASTA الأخرى على معلومات أخرى متعلقة بالحمض النووي ، مثل تلك التي تحتوي على FASTA و FAS و FA و FFN و FAA و FRN و MPFA و SEQ امتدادات الملفات أو NET أو AA.
هذه التنسيقات FASTA المستندة إلى النصوص نشأت في الأصل من حزمة برامج تحمل الاسم نفسه ، ولكنها تُستخدم الآن كمعيار في تطبيقات محاذاة تسلسل الحمض النووي والبروتين.
يشيرFNA أيضًا إلى بعض المصطلحات التقنية التي لا علاقة لها بتنسيق الملف هذا ، مثل القبول النهائي للشبكة ، وإمكانية زيادة اسم الملف / السمة ، وبنية شبكة Fujitsu ، وإعلان الجوار السريع.
كيفية فتح ملف FNA
افتح واحدًا في Windows و macOS و Linux مع Geneious (إنه مجاني لمدة 14 يومًا). للقيام بذلك ، انتقل إلى القائمة File> Import واختر استيراد الملف عبر From Fileعنصر القائمة.
قد تتمكن أيضًا من فتح واحد باستخدام BLAST Ring Image Generator (BRIG).
جرب Notepad ++ أو محرر نصوص آخر إذا لم تنجح هذه الأفكار. قد يكون الملف بالفعل نصيًا وسهل القراءة ، أو قد تجد أنه لا علاقة له بتنسيق FASTA ، وفي هذه الحالة ، قد يؤدي فتح الملف كمستند نصي إلى كشف النص الذي يحدد ما تم استخدامه لإنشاء الملف أو ما هو تنسيق الملف.
كيفية تحويل ملف FNA
لا يمكننا التحقق من ذلك نظرًا لأننا لم نجربه ، ولكن يجب أن تكون قادرًا على استخدام Geneious لتحويل الملف إلى العديد من التنسيقات الأخرى ، مثل FASTA و GB و GENEIOUS و MEG و ACE و CSV و NEX و PHY و SAM و TSV و VCF. يمكن القيام بذلك من خلال قائمة البرنامج File> Export.
يجب أن يكون البرنامج نفسه قادرًا أيضًا على حفظ الملف في PNG أو-j.webp
File> Save As Image File.
على الرغم من أنه لا يمكنك عادةً إعادة تسمية امتداد الملف إلى شيء آخر وتتوقع أن يعمل بنفس الطريقة ، يمكنك إعادة تسمية ملف. FNA إلى ملف. FA إذا كان برنامج تسلسل الحمض النووي الخاص بك سيتعرف فقط تنسيق FA.
بدلاً من إعادة تسمية امتدادات الملفات ، ستحتاج إلى استخدام محول ملفات مجاني لتحويل أنواع الملفات الأخرى. في حالة ملفات FNA و FA ، يحدث أن بعض البرامج ستفتح فقط الملفات التي لها امتداد ملف FA ، وفي هذه الحالة يجب أن تعمل إعادة تسميتها بشكل جيد.
لا يزال لا يمكن فتحه؟
إذا كنت لا تزال غير قادر على فتح ملفك بعد استخدام البرامج المذكورة أعلاه ، فقد تجد أن امتداد الملف لا يقرأ فعليًا. FNA ولكن بدلاً من ذلك شيء يبدو مشابهًا.
على سبيل المثال ، تبدو ملفات FNG (Font Navigator Group) كثيرًا كما يقولون ". FNA" ولكن إذا نظرت عن كثب ، فإن الحرفين الأولين فقط هما نفس الشيء. نظرًا لأن امتدادات الملفات مختلفة ، فهذا مؤشر على أنها ذات تنسيق ملف مختلف ومن المحتمل ألا تعمل مع نفس البرامج.
يمكن قول الشيء نفسه بالنسبة للعديد من امتدادات الملفات الأخرى مثل FAX و FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP) و FAT و FNTA (Aleph One Font) و FNC (Vue Functions) و FND (Windows Saved Search).
الفكرة هنا هي التأكد من أن امتداد الملف يقرأ FNA. إذا كان الأمر كذلك ، فحاول مرة أخرى استخدام البرامج المذكورة أعلاه لفتحها أو تحويلها. إذا كان لديك نوع مختلف من الملفات ، فابحث عن امتداده لمعرفة التطبيقات المطلوبة لفتحه أو تحويله.
التعليمات
كيف تفتح ملف FNA في بايثون؟
أولاً ، قم بتحويل ملف FNA إلى تنسيق FASTA باستخدام تطبيق تابع لجهة خارجية مثل Geneious. بعد ذلك ، يمكنك تنزيل Biopython ، وهي مجموعة من الأدوات المتاحة مجانًا للحساب البيولوجي للعمل في المعلوماتية الحيوية. أخيرًا ، ارجع إلى Biopython Tutorial and Cookbook للحصول على إرشادات حول العمل مع ملفات FASTA.
كيف يمكنني العثور على أرقام صانع FNA الخاصة بي في ملف خام Ancestry؟
يمكنك تنزيل معظم بيانات الحمض النووي من Ancestry.com بتنسيق.txt. ومع ذلك ، فإن العملاء الذين تم تحليل حمضهم النووي باستخدام تسلسل الجيل التالي (NGS) فقط لديهم خيار تنزيل ملف VCF.لتنزيل ملف VCF ، يجب أن تكون مالك الحمض النووي ، وتم اختبار الحمض النووي باستخدام تقنية NGS ، ولديك مساحة 350 ميجابايت على الأقل على جهازك.
